Jw_cad作者さんのサイトの掲示板で以下の発言がありました
いつもお世話になっております。
Jw-cadを起動した際、ツールバーが前回終了時の配置と変わって、
全て並列になって表示される場合があります。
なぜか毎回ではないのですが。
毎回同じ表示形式で立ち上げることはできませんでしょうか。

是非ご教示いただけますと幸いです。
どうぞよろしくお願い申し上げます。

Jw_cad を起動して、画面サイズを小さくしてみて下さい。
ツールバーの配置が自動的に変更されるのが確認できると思います。

ツールバーの配置状態は、前回終了時の状態を保存して
次回起動時に再現されます。

ツールバーの配置が乱れた状態で終了をすると、
次回起動時も　同じように　乱れた状態で表示されます。

で
Jw_cad を最小化状態（アイコン化状態）で終了をすると
ツールバーの配置は、
通常表示状態の画面サイズではなく
最小状態の画面サイズで終了されたと勘違いをして？
乱れた状態となって　保存されてしまいます。

なので、Jw_cad の画面を小さくしてしまったり、Jw_cad を最小化状態（アイコン化状態）で終了しないようにすれば　問題は解決です。

なお、Jwlayout は、Jw_cad の画面・ツールバーの配置が正常な状態で「保存」をしておかないといけませんので念のため。